Saint-Laurent-l'Abbaye possède un établissement religieux depuis au moins le 6e siècle. Au 11e siècle, une abbaye est signalée qui accueille les pèlerins de Saint-Jacques-de-Compostelle. Des Augustiniens occupent le site et ont de nombreuses possessions dans les environs.
En 1199, les alentours de l'Abbaye sont les lieux de batailles entre Pierre de Courthenay comte de Nevers et Hervé de Donzy.
L'abbaye est endommagée pendant les guerres de Religion et les derniers occupants partent un peu avant la Révolution française.
Après la Révolution, les bâtiments sont vendus à des particuliers, seule l'église sert encore, mais en 1816, un incendie détruit une partie des bâtiments et en 1948 le clocher de l'église s’effondre.
Aujourd'hui l'Association pour la Sauvegarde, la Protection et l'Amélioration du site, organise des visites pendant l'été et pour les Journées Européennes du Patrimoine.